十六世纪末，卫拉特蒙古逐渐崛起，他们游牧于天山以北的塔尔也哈台地区，伊犁河谷和额尔齐斯河两岸的广大草原，完全服属于清朝，向清朝纳贡。十七世纪初，它的势力已经越过伊犁河下游及以西地区广大哈萨克游牧草原，达到会中亚塔拉河流域，繁衍生息于这块土地上的塔塔尔人以游牧射猎为主，为卫拉特的属民。
十六世纪末与十七世纪初，当卫拉特人遭到沙俄侵略时，塔塔尔人也遭到战争的灾难。1589沙俄侵占塔拉河流域，建立了侵略据点。此后，塔拉河地区的一些塔塔尔人就逃到准噶尔部的辖区-阿尔泰山以东的科布多南北和额尔齐斯河上游到准噶尔盆地一带。1775年2月，清朝平复了额尔齐斯河上游到准噶尔封建贵族的叛乱后，收复了阿尔泰山以东的地区，居住在这儿的塔塔尔牧民和哈萨克大玉兹、中玉兹部落仍是清朝臣民。
