藏医学具有一套完整的理论体系，并有效地指导着临证实践。
从藏医学形成的过程中可以清楚地看到，在藏医形成的早期，也就是它的奠基时期，尤其是萌芽时期，藏族先民主要依靠自己本民族与疾病进行斗争，逐步积累经验，并且随着时间的推移而丰富起来。这些医药经验基本上都是一些朴素的、直观的感性知识。这种情况对世界上任何一种医学体系都是必经的过程。它是处于尚未具备理论内容的经验医学初期积累阶段。
—门科学之所以成为科学，光有经验知识是不够的，它只能停留在初级阶段，而不能进一步发展、提高。随着时间的推移、经验的增多和积累，人们必然会从中发现一些规律性的东西。这些规律性的东西经过条理化、系统化，便会上升到理论的阶段。有了理论，回过头来再在实践中检验其正确性，不断修正、提高，使实践的水平不断发展，并进一步总结出新的规律，这样循环往复，便是科学进步和发展的过程。医学的发展同样遵循着这样的过程，藏医学也不例外。
从前面的叙述中，可以清楚地看到，在它的奠基时期，藏医学曾经向邻近国家、地区和民族学习包括医学在内的各种知识。吐蕃王朝早期曾经从邻近的国家、民族延聘高明的医家入藏，传授医学；另一方面，吐蕃王朝也派医生到这些地区和国家，向他们学习，主要的有内地的汉族中医、还有古代印度的寿命吠陀医学以及大食国家的阿拉伯医学等，其中尤以前两者对藏医学形成的影响更为明显。
藏族人民善于吸收其他民族的优秀文化，并予以消化、吸收、改造和提高，使之与本民族的具体情况相结合，从而形成一种新的、具有本民族特色的文化体系。在医学上，这个特点反映尤其明显。如果我们了解藏医形成过程的具体历史，就能发现藏医理论体，系中，包含一些汉族中医、古印度吹陀医学影响的痕迹，就不会感到奇怪了。
