巳如前述，《四部医典》在8世纪末著成以后，就被赤松德赞秘藏起来，直到11世纪中，才被扎巴旺协从桑耶寺中取出，以后陆续转递，经宇陀萨玛最后进行修改补充，才算定型。其后的几百年时间里，历经各代医家的研究、修订、注释、增补，出现了不同的版本。其中最著名的当推舒卡洛最给布的扎塘版，影响最大，其他还有达丹版、乌东巴版、干木保版、宗嘎版等等的不同版本。此外，发挥和阐释《四部医典》的著作就更多了，形成不同的注家，还有不同学派的诠释，有些问题意见相左，争论不休，使读者无所适从。
有鉴于此，桑吉嘉措对《四部医典》及不同的注家著作进行了研究，他根据自已的经验体会，加上他总揽政权的有利条件，得以阅读到不少一般民间看不到的手抄本。他发现，扎塘版的内容有不少错误和缺漏之处，还有一些难懂晦涩的内容。尽管《四部医典》内容丰富、理论完整，但因为它是以偈颂文体写成，也就是韵体文的体裁，故比较难懂。因此，桑吉嘉措重新作了修订和注释，集诸家之长，去粗取精，去伪存真，用通俗的叙述文体写成了《四部医典蓝琉璃》，全名《医学广论药师佛意庄严四续光明蓝琉瑰》，简称《蓝琉璃》，其篇幅较《四部医典》原著多出一倍以上。
由于《蓝琉璃》内容通俗易懂，而且内容丰富，为后世医家所推崇，认为是一部权威的《四部医典》原著的诠释，甚至有人认为：如果说《四部医典》是一把金锁的话，那么《蓝琉璃》就堪称为打开这把金锁的金钥匙，被后世奉为学习《四部医典》的必读著作、标准注释本，至今仍然是学习这部经典医著的入门．它对于普及藏医学、发展藏医学具有重大的作用。
